TNT在2015年8月11日宣布续订《末日孤舰》（The Last Ship）第三季。埃里克·迪恩（Eric Dane）饰演一艘海军驱逐舰的舰长钱德勒（Captain Chandler），在侥幸躲过一场让地球上大多数人丧命的灾难后，作为为数不多的幸存者，他必须要和船员们寻找出路。TNT续订《末日孤舰 The Last Ship》13集的第3季，这部由Michael Bay作为执行制片人的剧集，收视在TNT中表现得很好，续订完全没有悬念可言。在第二季中，钱德勒和船员们致力于发放解药，但当他们返回美国后，却遭到了其他想争夺权力的党派和天生对瘟疫免疫想要统治世界的幸存者们的反对 [3]  。昔日人马早已散去，钱德勒舰长另任新职，xo斯莱特林担任DDG151号上的新舰长(确认卡拉不再担任TAO)，在钱德勒赴中国之后，斯莱特林遭到袭击被绑架，钱德勒受总统之令再度召集原班人马wolf等人，前去救援。内森詹姆斯号越南遇袭。全世界都在从经历了恐怖的病毒袭击中慢慢恢复，在美国的密苏里州圣路易斯市，新任的美国总统杰夫瑞米切纳在通过电台向全美国人民发表讲话。而此时拯救了世界的美国海军舰内森詹姆斯号舰长钱德勒正开着车在街头，他看到了街上的人民正在慢慢的恢复正常的生活，在银行没有办法正式运作前，政府封发了配给票用来替代交易的货币。街头的建筑上也有钱德勒喷漆头像。 　　日本南部，因为病毒的突然变异导致美国生产的治愈药没有效果，到处都是因为病毒而死亡的人，一位老妇在一个小女孩旁边正准备给她再打一针治愈药，可是小女孩病没有撑过去，老妇看着死去的亲人悲痛欲绝。 　　在美国，海军军士官格林的妻子卡拉正在跟自己的丈夫在进行视频通话，但是因为一些不明的阻扰通讯没办法进行。 南海，内森詹姆斯号上正在继续着分发治愈药的行动，因为现在还有很多地区的人没办法得到治愈药，全世界的治愈药都靠着詹姆斯号进行分发。因为钱德勒当上了海军作战部部长，因此内森詹姆斯号的新舰长是迈克。 　　美国圣路易斯市，钱德勒拿着卡拉给他的配给票，为了纪念蕾切尔博士他们在配给票一面印上了她的头像，钱德勒看着为了研究治愈药而死亡的蕾切尔博士，他觉得无论怎样做都没办法感谢蕾切尔所做的一切。总统办公室内，外交部长跟总统正在讨论，他们觉得中国的彭主席囤积了大部分的治愈药而没有分发给周围的国家为的就是控制亚洲，但是也导致了病毒的变异从而死日本等地区大范围的人死亡。杰夫瑞总统在香港安排了一场跟彭主席的见面，当中了包括了很多亚洲其他国家的领导人。钱德勒觉得外交部长亚历克斯去比较好，但是总统却希望由他去中国香港跟彭进行会面。